04 al 08 Noviembre 2019
Aula de Posgrado Facultad de Ciencias Agrarias UNR
Campo Experimental Villarino – Zavalla Santa Fe

Cuerpo docente
Coordinador:
Dra. Juliana Stein
Docentes
Dra. Ma. Amalia Chiesa
Dra. Luciana Delgado
Dra. Maricel Podio
Dra. Valeria Perotti
Dra. Lorena Siena

Destinado a

  • Graduados de las carreras de Ingeniería Agronómica, Lic. en Recursos Naturales, Lic. en Biotecnología, Bioquímica, Lic. en Genética u otras afines.
  • Estudiantes de doctorados o maestrías relacionados con las ciencias biológicas.

Objetivo general
Este curso tiene como objetivo presentar una visión práctica de las técnicas de biología molecular utilizadas actualmente de rutina cuando se estudian los genomas de las plantas superiores.

Objetivos específicos en términos de habilidades a adquirir por parte de los estudiantes
Nos proponemos que al finalizar el cursado los estudiantes hayan:

  • comprendido los conceptos básicos y metodológicos de las técnicas de biología molecular que permiten estudiar el genoma vegetal.
  • adquirido destreza en el manejo del equipamiento y en la manipulación de muestras biológicas en el laboratorio
  • desarrollado habilidad en el análisis de resultados y pensamiento crítico frente a diferentes situaciones prácticas

Programación de Contenidos

Técnicas de Biología Molecular para el estudio del genoma vegetal

 Unidad 1: Introducción al estudio de los genomas vegetales.
Características particulares del genoma de plantas superiores. El ADN y los cromosomas. Centrómeros y telómeros. Organización de los genes en el genoma nuclear. Genoma de cloroplastos y de mitocondrias. Mutaciones. Banco de mutantes de Arabidopsis thaliana. Genotipado.

Unidad 2: Técnicas de extracción y purificación de ADN vegetal.
Tipos de muestras biológicas. Métodos: CTAB, Dellaporta, comerciales. Electroforesis de ácidos nucleicos.
Cuantificación de ácidos nucleicos por espectrofotometría. Índice de pureza.

Unidad 3: PCR.
PCR estandar y cuantitativa. Diseño de cebadores. Uso de herramientas informáticas.

Unidad 4: Genómica.
Secuenciación de ADN. Métodos. Bioinformática: principios necesarios para comprender los fundamentos teóricos del análisis bioinformático, ejemplos de análisis específicos utilizando software web de libre acceso y bases de datos disponibles públicamente.

Unidad 5: Clonado de genes vegetales en E. coli.
Vectores, enzimas de restricción, ligasas, transformación bacteriana, minipreparaciones plasmídicas.

Unidad 6: Marcadores moleculares.
Técnicas de obtención de marcadoresmoleculares basados, en PCR y en secuencia (SNPs, GBS). Aplicaciones al mejoramiento genético vegetal, al estudio de caracteres de interés y en filogenia.

Unidad 7: Herramientas para un genotipado dirigido.
PCR alelo-específica (ASP y ASQ). Análisis de secuencias polimórficas amplificadas y digeridas (CAPS y dCAPS). Análisis de curvas de melting de alta resolución (HRMA). Descripción general de cada técnica. Análisis comparativo. Ejemplos de aplicación.

Clases de Laboratorio:

  • 1º Sesión: Extracción y purificación de ADN genómico a partir de dos genotipos de Arabidopsis Thaliana, obtenidos de un banco de germoplasma TAIR. Método de Edwards.
  • 2º Sesión: Genotipado de las líneas mediante PCR.
  • 3º Sesión: Visualización de los productos de PCR en gel de agarosa. Elaboración de Informe de los resultados obtenidos.

Clases Prácticas:

  • Bioinformática: uso de programas y herramientas bioinformáticas para el análisis de secuencias de ADN. Bases de datos. Diseño de cebadores para PCR.
  • 2-3) Clonado de genes vegetales en bacterias / Marcadores moleculares /
  • Genotipado dirigido: ejemplos bibliográficos, discusión grupal e interpretación de resultados.
  • 4) Discusión general integradora: se plantearán interrogantes que surgen durante los proyectos de investigación y se intentará su resolución individual y/o grupal.

Cronograma

Lunes

Martes Miércoles Jueves Viernes
Unidad 1
2h
Unidad 3
2 h
Unidad 5
2h
Unidad 6
2h
Discusión final
Integradora
2h
Unidad 2
2 h
Laboratorio 2
2h
Práctica Casos
Bibliográficos
2h
Unidad 7
2h
Laboratorio 1
3h
Unidad 4
2h
Laboratorio 3
3h
Discusión resultados
Práctica Casos
Bibliográficos
3h
Evaluación Final
2h
Práctica
Bioinformática
1h

Carga Horaria: 30 horas

Modalidad de aprobación
Asistencia al 80% de las clases. Examen final presencial. El mismo consistirá en la interpretación y resolución de un caso práctico que será analizado en grupo de dos personas.

Metodología de la enseñanza
El curso se estructura en 7 (siete) sesiones teóricas de dos horas cada una, dictadas por docentes investigadores especialistas en las áreas abordadas. Las clases teóricas se dictarán con el apoyo de presentaciones de PowerPoint, vídeos y el uso de programas de procesamiento de datos. Además, se organizarán 7 (siete) sesiones de Actividades Prácticas:

  1. 3 (tres) clases de laboratorio y
  2. 4 (cuatro) clases prácticas: una de bioinformática, dos de discusión de casos bibliográficos y una de discusión integradora.

Arancel: Consultar

Bibliografía relacionada

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