El Herbario de la FCA-UNR, inscripto en el Index Herbariorum -un registro internacional de colecciones botánicas- es uno de los pocos herbarios existentes con numerosas plantas de la Provincia de Santa Fe.

Desde su inicio en 1972 a la actualidad, ha logrado reunir unos 12.000 ejemplares, representados en 134 familias botánicas. Se han identificado y catalogado casi 9.000 ejemplares correspondientes a 1.500 especies. Esto representa la mayor parte de la flora de la provincia, convirtiendo a la colección en uno de los documentos más preciados de la naturaleza y biodiversidad de Santa Fe.

El herbario reúne también una colección de plantas del partido de Pergamino, que si se compara con la colección realizada a principios del siglo pasado por el profesor Lorenzo R. Parodi, constituye el único documento existente sobre la erosión de la biodiversidad botánica y las invasiones vegetales a la que está sometida la región pampeana.

Esta colección, administrada por las cátedras de Botánica y Ecología Vegetal, es además la base de importantes estudios florísticos desarrollados actualmente y ha servido en forma directa o indirecta a más de 60 publicaciones científicas y 10 tesis doctorales y de maestría.